Навчальний відділ є структурним навчальним і науково-методичним підрозділом Вінницького національного медичного університету, що проводить планування, організацію та управління навчальною та науково-методичною діяльністю, впроваджує в діяльність навчальних підрозділів університету нові підходи до організації навчального процесу, здійснює контроль за якістю та ефективністю навчального процесу, облік та звітність з питань навчально-методичної роботи.